Στις αρμοδιότητες της Δ/νσης Προγραμματισμού υπάγονται όλα τα θέματα που άπτονται της αναπτυξιακής διαδικασίας του Νομού. Εκπονεί σχέδια προγραμμάτων - έργων - μέτρων οικονομικής κοινωνικής και πολιτιστικής ανάπτυξης, εισηγείται κατανομή δαπανών για την εφαρμογή αυτών, υποστηρίζει επιστημονικά και τεχνικά τις Υπηρεσίες και τα όργανα της Ν.Α. για την εφαρμογή αποφάσεων που αφορούν αναπτυξιακά Προγράμματα, μέσα από τις σχέσεις της Ν.Α. με τα κράτη μέλη και τις Περιφερειακές Αρχές της Ευρωπαϊκής Ένωσης, τις Τρίτες Χώρες και τους Διεθνείς Οργανισμούς. Επίσης έχει την αρμοδιότητα να συνεργάζεται με όλους τους αναπτυξιακούς φορείς τοπικού ή κεντρικού επιπέδου του Δημοσίου, των Ν.Π.Δ.Δ, των Ν.Π.Ι.Δ. για την ορθολογικότερη χρήση - εφαρμογή των στρατηγικών ανάπτυξης του Νομού.

Η Διεύθυνση έχει την ευθύνη της προαγωγής στο Νομό, της Δασοπονίας, της Αλιείας και της Ιχθυοκαλλιέργειας καθώς και των Εγγείων Βελτιώσεων στην περιοχή Βοιωτίας.

Αποστολή της Δ/νσης είναι, η προαγωγή της Φυτικής Παραγωγής και της Κτηνοτροφίας στα πλαίσια του Εθνικού Σχεδιασμού και των προγραμμάτων γεωργικής και κτηνοτροφικής ανάπτυξης του Υπουργείου Γεωργίας και της Κοινής Αγροτικής Πολιτικής της Ευρωπαϊκής Ένωσης. Επίσης η Διεύθυνση είναι αρμόδια για όλα τα θέματα που ανάγονται στη γεωργική και κτηνοτροφική ανάπτυξη του τομέα φυτικής και ζωικής παραγωγής στην περιοχή της Νομαρχιακής Αυτοδιοίκησης Βοιωτίας. Βρίσκεται σε αδιάκοπη επαφή και συνεργασία με τις συνεταιριστικές οργανώσεις και τους αγροτικούς συλλόγους των παραγωγών και των κτηνοτρόφων, καθώς και με τις άλλες υπηρεσίες και τα ιδρύματα που εξυπηρετούν τον αγροτικό κόσμο, για την κατάρτιση και την εφαρμογή των προγραμμάτων αγροτικής και κτηνοτροφικής ανάπτυξης και της επιβαλλόμενης αναδιάρθρωσης των γεωργικών καλλιεργειών και των κτηνοτροφικών εκμεταλλεύσεων στην περιοχή του νομού. Τέλος έχει την ευθύνη της συνεχούς παρακολούθησης και ενημέρωσής της στην Κοινοτική Νομοθεσία που αναφέρεται στα Διαρθρωτικά Ταμεία της Ευρωπαϊκής Ένωσης (FEOGA EKT, κλπ) και στα εκάστοτε εγκρινόμενα προγράμματα στα πλαίσια της Κοινοτικής, Αγροτικής, Πολιτικής της Ευρωπαϊκής Ένωσης σε συνδυασμό με τις δεσμεύσεις και τις δυνατότητες που παρέχονται από τις ρυθμίσεις της Γενικής Συμφωνίας Δασμών και Εμπορίου (ΠΟΕ). Οι αρμοδιότητες της Δ/νσης Γεωργίας ανάγονται στα θέματα του Υπουργείου Γεωργίας για τα οποία η σχετική δικαιοδοσία έχει μεταβιβαστεί στους Νομάρχες καθώς και σε εκείνα που πρόκειται να μεταβιβαστούν εφεξής. Οι αρμοδιότητες αυτές κατανέμονται μεταξύ των ακολούθων Τμημάτων σύμφωνα με την κατανομή που ορίζεται από το άρθρο 90 του Π.Δ 433/1977 ""Περί Οργανισμού του Υπουργείου Γεωργίας"" (ΦΕΚ Α΄133), σε συνδυασμό με τις διατάξεις του Π.Δ 332/1983 (ΦΕΚ Α΄119).

Αρμοδιότητες της Διεύθυνσης Τεχνικών Υπηρεσιών είναι η μελέτη, εκτέλεση και συντήρηση των δημοσίων έργων Νομαρχιακού επιπέδου, και η συντήρηση και διάθεση του τεχνικού εξοπλισμού. Στις αρμοδιότητες της διεύθυνσης επίσης ανήκουν: 1) Η διενέργεια αναγκαστικών απαλλοτριώσεων για την κατασκευή δημοσίων έργων (αγροτικών ακινήτων μέχρι 15.00 τ.μ. αστικών ακινήτων εντός οικισμών χωρίς σχέδιο πόλεως μέχρι 1.500 τ.μ, υπέρ του δημοσίου και ΔΕΚΟ ή έκτασης μέχρι 100.000 τ.μ για κατασκευή επαρχιακών οδών, η κτηματογράφηση των απαλλοτριωμένων.) 2) Η ρύθμιση θεμάτων των επαρχιακών οδών (όπως η έγκριση κυκλοφοριακών συνδέσεων, κατάργηση τμημάτων επαρχιακών οδών λόγω νέας χάραξης). 3) Η προστασία των λιμένων και η κατασκευή έργων λιμενικών ( καθορισμός χερσαίας ζώνης λιμένα και τμημάτων που μπορούν να περιφραχθούν, άδεια κατασκευής τεχνικών έργων και έγκριση μελέτης ιδιωτικού λιμενικού έργου) καθώς και η εποπτεία εκτέλεσης έργων κατασκευής και επισκευής κτιρίων Λιμενικών Αρχών και Δημοσίων Σχολών εμπορικού ναυτικού. 4) Η προστασία των δημοσίων υδάτων ( καθορισμός οριογραμμής ρευμάτων ή ρυακιών σε ρυμοτομικά σχέδια αρμοδιότητας του νομάρχη, άδειες κατασκευής έργων στην κοίτη ή την περιοχή ποταμών, χειμάρρων, οχετών και διωρύγων ή έργων που μπορεί να αλλοιώσουν τις παροχετεύσεις), ο έλεγχος τήρησης της νομοθεσίας και η επιβολή των προβλεπόμενων κυρώσεων, καθώς και η ρύθμιση θεμάτων λειτουργίας των υδρολογικών σταθμών. 5) Η ρύθμιση θεμάτων δημοσίων έργων (έγκριση παρεκκλίσεων από τη νομοθεσία για την εκτέλεση νομαρχιακών έργων). 6) Η εγγραφή στα Νομαρχιακά μητρώα επιχειρήσεων που δεν είναι στο ΜΕΕΠ καθώς και τήρηση μητρώου εμπειροτεχνών. 7) Η χορήγηση αδειών κυκλοφορίας μηχανημάτων έργων, μεταβιβάσεις αδειών Μ.Ε., διαγραφές Μ.Ε., ακινητοποιήσεις Μ.Ε., βεβαιώσεις για δημοπρασίες σχετικές με κατοχή Μ.Ε., σύνταξη απογραφικών δελτίων, έκδοση σημειωμάτων καταβολής τέλους για απογραφή-ταξινόμηση και χορήγηση αδείας και πινακίδων κυκλοφορίας Μ.Ε., τήρηση μητρώου Μ.Ε. 8) Η εκτέλεση (μελέτη-κατασκευή) έργων άλλων φορέων που δεν έχουν οι ίδιοι τεχνικές υπηρεσίες, εφόσον ανατεθούν αρμοδίως, κατά τις ισχύουσες διατάξεις. 9) Ο ποιοτικός έλεγχος των εκτελούμενων έργων. 10) Η μέριμνα και εξασφάλιση ετοιμότητας του αναγκαίου μηχανικού εξοπλισμού προκειμένου να αντικατασταθούν έκτακτες ανάγκες του Νομού (σεισμοί, πλημμύρες κλπ) 11) Η διοίκηση των Τμημάτων και των Γραφείων που ανήκουν στην Υπηρεσία.

Αρμοδιότητα της Διεύθυνσης Κοινωνικής Πρόνοιας είναι η βελτίωση και μεγιστοποίηση των παρεχομένων από τη Νομαρχιακή Αυτοδιοίκηση υπηρεσιών στους τομείς της Κοινωνικής Πρόνοιας και επί των θεμάτων που αναφέρονται στο Π.Δ. 224/1989{ΦΕΚ Α΄ τ. 104} οργάνωση των Υπηρεσιών Υγείας και Πρόνοιας, σε συνδυασμό με το σύνολο των διατάξεων για μεταφορά αρμοδιοτήτων των Υπηρεσιών του Υπουργείου Υγείας και Κοινωνικής Αλληλεγγύης.

Στην Διεύθυνση Πολιτισμού και Τουρισμού ανήκει η αρμοδιότητα για την αξιοποίηση της πολιτιστικής κληρονομιάς της περιοχής του Νομού Βοιωτίας και την Τουριστική ανάπτυξή της.

Αρμοδιότητα της Διεύθυνσης Δημόσιας Υγείας - Πρόνοιας και Κοινωνικών Ασφαλίσεων είναι η βελτίωση και μεγιστοποίηση των περιεχομένων από τη Νομαρχιακή Αυτοδιοίκηση υπηρεσιών στους αντίστοιχους τομείς Υγείας, Πρόνοιας και Κοινωνικών Ασφαλίσεων και ο συντονισμός των επί μέρους τμημάτων από τις οποίες συγκροτείται, με σκοπό τη με μεθοδικότητα, ουσιωδέστερη και αποτελεσματικότερη εκτέλεση του έργου τους.